La polihexametilenguanidina (PHMG) s'utilitza àmpliament en els camps de la desinfecció i la higiene, trobant aplicació en productes com ara solucions per a la cura de lents de contacte, desinfectants de mans, rentats vaginals i desinfectants per a la pell i ferides; també serveix com a desinfectant domèstic. En el sector de la cosmètica i la cura personal, s'incorpora tant als productes de deixar-que esbandida-que esbanden-com ara cremes, locions, màscares facials, articles per a la cura del nadó, tovalloletes humides, xampús i condicionadors per al cabell.
A la indústria tèxtil, PHMG permet l'acabat antimicrobià de teixits no-teixits, teixits i fibres de viscosa mitjançant processos com ara l'enrotllament de coixinets-, immersió o polvorització; aquest tractament demostra durabilitat, suportant més de 50 cicles de rentat. Dins dels sectors industrial i de tractament d'aigües, s'utilitza per a la desinfecció d'envasos, canonades i sòls d'instal·lacions a les indústries d'alimentació, cervesa i begudes; per a l'eliminació d'algues en ambients aquàtics; i per a la floculació i clarificació de sòlids en suspensió durant el tractament de l'aigua. A més, funciona com a floculant i desinfectant en el processament de fruites i verdures, aqüicultura i tractament d'aigües residuals.
En l'àmbit dels materials antimicrobians, el PHMG es pot incorporar en forma sòlida per fabricar plàstics antimicrobians-com ara PP, PE i lots mestres antimicrobians-a més de silicona i fibres antimicrobianes. A la indústria paperera, actua per matar i inhibir el creixement microbià alhora que dispersa i elimina els dipòsits enganxosos, mantenint així la neteja de l'aigua blanca circulant. Finalment, en el context dels productes d'higiene d'un sol ús, s'utilitza per al tractament superficial de coixinets higiènics, protectors de calces i bolquers per a nadons.
